由于每种培养基所需的营养成分不同，因此培养基的种类很多，目前估计有数千种，根据其成分、物理条件和使用目的可分为多种类型。
1.取决于介质的成分
培养基按其成分分为三种类型：合成培养基、天然培养基和半合成培养基。
(1)合成培养基。合成培养基的每种成分都是已知的化学物质。该培养基的化学成分清晰、准确、重现性好。但价格较高，且该类培养基中微生物生长缓慢。例如高氏1号合成培养基、Czapek培养基等。
(2)天然培养基采用蒸土豆、普通牛肉汤等天然产物制成。前者用于培养真菌，后者用于培养细菌。虽然其化学成分极不稳定且难以测定，但其制备简单且营养丰富。丰富且经常使用。
(3)半合成培养基半合成培养基是在天然有机质的基础上酌情添加已知成分的无机盐，或者在马铃薯葡萄糖琼脂培养基等合成培养基中添加一些天然成分，从而更有效地满足微生物的需要。培养基的营养要求。
2.取决于介质的物理状态
介质按其物理状态分为三种类型：固体介质、液体介质和半固体介质。
(1)固体培养基如琼脂、明胶、硅胶等添加凝固剂的培养基常用于微生物菌株的分离、鉴定、计数和保存。
(2)液体培养基不添加凝固剂，成分均匀，微生物能充分接触和利用培养基中的营养物质，适合生理研究。
(3)半固体培养基在液体培养基中加入少量凝固剂，使其成为半固体，可用于观察细菌运动、鉴定菌株、测定噬菌体效价等。
3.取决于微生物的种类
根据微生物种类，培养基有细菌培养基、放线菌培养基、酵母培养基和霉菌培养基四种。
常用的细菌培养基包括营养肉汤和营养琼脂，放线菌培养基包括高氏1号培养基，常用的酵母培养基包括马铃薯蔗糖培养基和麦芽汁培养基。
4.利用媒体
培养基按其特殊用途可分为富集培养基、选择性培养基和分化培养基。
(1)浓缩培养基：在培养基中添加血液、血清、动植物组织提取物，培养某些要求相对严格的微生物。
（二）选择性培养基是根据特定菌种或类型微生物的特殊营养要求或理化抗性而设计的培养基。使用这种培养基可以从混合微生物中分离出所需的微生物。
(3)培养基的鉴定：在培养基中添加特定的试剂或化学物质，使培养后引起特定的变化，以鉴定不同种类的微生物。
